イオとの死闘を制したダリルは、ジオン残党軍の一員として地球にいた。彼は奪われたサイコ・ザクの情報を得るための諜報任務に就いていたのだ。
一方、新たな仲間と共に「サンダーボルト作戦」に参加したイオの前に、南洋同盟国境守備隊隊長を名乗るペール中佐が立ち塞がる。
海中で、氷原で、密林で繰り広げられる、ジオン、連邦、南洋同盟、三つ巴のモビルスーツ戦。
戦争はまだ、終わってはいなかった――。Universal Century 0080, eight months after the One Year War, an Earth Federation spaceship is tasked to retrieve the Pyscho Zaku from the hands of the South Seas Alliance, a cult that makes its followers sacrifice their limbs to control the mobile suits. To the spaceship's aid is the Atlas Gundam, a new amphibious mobile suit piloted by Io Fleming. Meanwhile, Daryl Lorenz joins the Zeon Remnants on Earth whose mission is also to retrieve the Psycho Zaku.
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